“生物工程”学科是在70余年历史的农学、畜牧学、食品加工等学科基础上，随生物技术的创新发展建立起来的。学科在2008年被列入浙江省首批重中之重学科，2016年和2022年连续进入浙江省一流学科(A类)建设行列。学科立足国家和浙江省生物种业、生命健康等重大战略需求，主要开展细胞与种质工程、微生物工程与应用、生化工程与制品开发的应用基础和技术创新等研究。
学科现有成员45人，含中国杰出青年基金获得者、农业部岗位科学家、农业农村部神农英才等人才，建有国家级实验教学示范中心、省级重点实验室、省级工程研究中心、省级现代产业学院等平台，实验室面积超10000m²，仪器设备总值逾亿元，硬件条件达国内同类学科先进水平。近年来，承担国家杰出青年科学基金、国家优秀青年科学基金、国家重点研究计划课题、国家自然科学基金联合重点项目、浙江省重点研发计划项目等国家级、省部级项目100多项，在国内外高水平期刊上发表论文400余篇，其中SCI、EI收录论文200余篇，在《Science》上发表论文3篇;授权发明专利70余项，获浙江省自然科学奖、浙江省科技进步奖等省部级一、二等奖项10余项。
